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Yang

Yersinia Pestis Protocols

Medium: Buch
ISBN: 978-981-13-4024-6
Verlag: Springer
Erscheinungstermin: 29.12.2018
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This protocol book includes common and advanced research protocols for Yersinia pestis research and for its identification, genotyping and source-tracing. This book includes protocols for genomic and transcriptomic analysis, small RNA study, protein-protein interaction, gene deletion. It will be helpful for graduate students, clinicians, and researchers in infectious diseases, systems biology, and evolution and numerous other relevant fields.

Produkteigenschaften

  • Artikelnummer: 9789811340246
  • Medium: Buch
  • ISBN: 978-981-13-4024-6
  • Verlag: Springer
  • Erscheinungstermin: 29.12.2018
  • Sprache(n): Englisch
  • Auflage: Softcover Nachdruck of the original 1. Auflage 2018
  • Serie: Springer Protocols Handbooks
  • Produktform: Kartoniert, Paperback
  • Gewicht: 637 g
  • Seiten: 290
  • Format (B x H x T): 178 x 254 x 16 mm
  • Ausgabetyp: Kein, Unbekannt

Themen

Autoren/Hrsg.

Herausgeber

Isolation and identification of Yersiniapestis .- Isolation and characterization of Yersiniapestis bacteriophages.- Extraction of chromosomal DNA and plasmid from Yersinia pestis.-  Extraction of total RNAs from Yersinia pestis.-  Genotyping of Yersinia pestis.-  Genome-wide variation analysis of Yersinia pestis.-  Genome-wide detection of expressed sRNAs in Y. pestis with RNA-seq.- Validation of Y. pestis sRNAs with nonradiative-labeled Northern Blot.- Determination of transcriptional start sites (TSSs) in Y. pestis with a primer extension assay.- Purification of Hfq-associated RNAs with RNA immunoprecipitation (RIP).- Overexpression of target sRNA in tightly controlled multicopy plasmids.- Target validation of sRNA with a GFP reporter gene fusion system.- Inducible gene expression in Yersinia pestis.-  Analysis of Yops secretion by Y. pestis Type III secretion system.- Co-Immunoprecipitation analysisfor detection of protein-protein interaction in Y. pestis.- Detection of type III secretion system needle assembly in Yersinia pestis by cross-linking of YscF.- Evaluation of protein translocation into eukaryotic cells by Y. pestis.-  Adhesion analysis of Y. pestis to the host cells.- Construction of gene deletion mutants in Yersinia pestis.- CRISPR-Cas12a–assisted recombineering in Yersinia pestis.- Plasmid curing in Yersinia pestis.-  Genetic regulation analysis of Yersinia pestis.-  Investigation of Biofilm formation in Y. pestis.-  Extraction and purification of F1 capsule antigen from Y. pestis.-  Screening of regulator responses to Yersinia pestis infection with a concatenated tandem array of transcription factor response elements-pull down.- Animal models for Yersinia pestis.-  Antibiotic resistance evaluation of Yersinia pestis.-  PCR for detection and identification of Yersinia pestis.-  Immunological methods for detection and identification of Yersinia pestis.-  Analysis of fatty acids in Yersinia pestis by gas chromatography.- Evaluation of efficacy of Yersinia pestis   vaccine.- Online resources for Yersinia pestis.-  Effects of Y. pestis on macrophage.